460 papers
Dit onderzoek toont aan dat klimaatcycli de demografische geschiedenis en genomische divergentie van de woestijnzanger (Campylorhynchus brunneicapillus) in Noord-Amerikaanse warmte-woestijnen hebben gevormd, wat leidde tot de splitsing in continentale en schiereilandpopulaties en de evolutie van C. affinis.
Dit onderzoek analyseert archeologische tandglazuurproteïnomes om de invloed van in vivo vertering en fosforylering tijdens de glazuurvorming te begrijpen en introduceert een nieuwe fosforyleringsgebaseerde marker voor het bepalen van genetisch geslacht.
Deze paper introduceert WINDEX, een hiërarchisch model dat site- en window-gebaseerde statistieken integreert om de detectie en lokale precisie van positieve selectie in genomische data te verbeteren en een schatting te geven van het percentage van het genoom dat onder selectiedruk staat.
Dit onderzoek toont aan dat in een genesteerde co-evolutiemodel van gastheer en parasiet, coinfecties leiden tot lagere virulentie en hogere weerstand dan superinfecties, waarbij de mate van ruimtelijke koppeling van de populatie de grootte van dit kinselectie-effect bepaalt.
Dit onderzoek toont aan dat bij tropische eilandendemies de demografische respons op klimaatverandering wordt bepaald door soortkenmerken zoals lichaamsgrootte en dieetspecialisatie, waarbij grote specialisten kwetsbaarder zijn en vaak met een lage effectieve populatiegrootte de Holoceen zijn ingegaan, wat noodzaak legt voor een geïntegreerd behoudsbeleid dat historische demografie en eigenschappen meeneemt.
Dit onderzoek toont aan dat structurele genomische variaties, met name deleties en inserties die genen met betrekking tot reproductie en zintuiglijke aanpassing beïnvloeden, een cruciale rol spelen in de soortvorming en evolutionaire divergentie van twee Noord-Amerikaanse hertensoorten.
Dit onderzoek suggereert dat de evolutie van adaptieve immuniteit niet primair werd gedreven door de noodzaak om parasieten te bestrijden, maar door de selectiedruk om complexe, vaak nuttige microbiota te beheren terwijl het risico van zeldzame parasitaire infecties wordt geminimaliseerd.
Deze studie waarschuwt dat 'Occam's bias' in fylogenetische lineaire modellen tot misleidende conclusies kan leiden en pleit daarom voor het gebruik van multi-respons modellen die alle causale relaties tussen voorspellers expliciet meenemen.
De studie toont aan dat de genetische architectuur van hersen-gerelateerde eigenschappen wordt gevormd door sterke selectiedruk en een groot mutatiedoelwit, wat leidt tot minder significante GWAS-resultaten vergeleken met andere complexe menselijke eigenschappen.
Deze studie toont aan dat de genotypen-phenotypen-architectuur, met name de keuze tussen modulaire of gecorreleerde eigenschappen, een fundamentele filter is voor biodiversiteitspatronen die de interactie tussen selectiekracht, migratie en ecologische filtering bepaalt.
Dit onderzoek karakteriseert het Toll-like receptor (TLR)-genrepertoire in elasmobranchs, onthult lijn-specifieke evolutiepatronen en positieve selectie door pathogendruk, en identificeert co-lokalisatie met MHC-gebieden die wijzen op een evolutionair hotspots voor de immuniteit van gewervelden.
Dit onderzoek integreert geautomatiseerde beeldanalyse, GWAS en vergelijkende pan-genomica om aan te tonen dat Heliconius-vlinders via soort-specifieke genetische paden binnen een bewaard regulatoir raamwerk convergente vleugelpatronen ontwikkelen.
Dit onderzoek toont aan dat de diversificatie van Australische diplodactylide hagedissen het resultaat is van milieuvanwisselingen en habitatverschuivingen die, na een oorspronkelijke boomlevende oorsprong, herhaalde overgangen naar drogere biomen en morfologische aanpassingen mogelijk maakten.
Deze paper introduceert een synthetisch kader genaamd "structurele evolutionaire invasieanalyse" dat complexe levenscycli in gestructureerde populaties wiskundig reduceert tot een hanteerbaar model, waarbij de evolutionaire uitkomsten onder zwakke selectie exact gelijk blijven aan die van het volledige model.
Dit onderzoek toont aan dat de evolutie van het werveldierforebrain plaatsvindt door lijn-specifieke aanpassingen van diep geconserveerde transcriptieprogramma's binnen stabiele celarchitecturen, waarbij een nieuw ontwikkelde, evolutionair onderbouwde genenset-methode een verenigd atlas van elf soorten mogelijk maakt.
Om de moeilijke fylogenetische relaties binnen de Clusioid-clade van de Malpighiales op te lossen, hebben de auteurs een verbeterde Hyb-Seq-probe-set (Clusioids626) ontwikkeld die universele en lijn-specifieke doelen combineert, wat leidt tot een volledige resolutie van de stambomen en het blootleggen van sterke conflicten tussen cytoplasmatisch en nucleair DNA.
Dit experimenteel evolutionaire onderzoek toont aan dat de leeftijdsstructuur van gastpopulaties een primaire drijvende kracht is in de evolutie van virulentie bij het TuMV-virus, waarbij verschillende demografische regimes leiden tot gespecialiseerde of generalistische virussen met uiteenlopende effecten op ziekteprogressie en symptoomernst.
Dit onderzoek toont aan dat verschillen in de verdeling van fitness-effecten van mutaties onder 38 katarrhine primaten voornamelijk worden gedreven door variatie in de effectieve populatiegrootte en de daaruit voortvloeiende werkzaamheid van natuurlijke selectie, in plaats van door cladespecifieke factoren.
Dit onderzoek toont aan dat hoewel de evolutie van antibiotica-resistentie bij de meeste *E. coli*-stammen voorspelbaar is, specifieke verstoringen van celprocessen via functie-specifieke epistasie tot afwijkende en langzamere evolutiepaden leiden die kunnen worden benut om behandelingen te verbeteren.
Deze studie analyseert het oude DNA van twee meloenzaden uit de Song-dynastie in China en concludeert dat deze vruchten, hoewel ze afstammen van geïntroduceerde Aziatische variëteiten, waarschijnlijk werden geconsumeerd als groente- of fruitsoort met een groen vruchtvlees die aansluit bij de esthetische voorkeuren van die periode, in plaats van als zoete dessertmeloen.